2000年7月，44岁的赵振元被任命为信息产业电子第十一设计研究院院长，开始进入自己职业生涯的新赛道。此前，他1976年从西安交通大学毕业后，一直在研究院（1964年成立的第四机械工业部第十一设计院）工作，先后历任工程师、整改办副主任、院办副主任、绵阳分院副院长、院长，十一设计院党委副书记、副院长。2000年对第十一设计研究院院也是一个重大转折。这一年，在赵振元的带领下，研究院开始拉开改革大幕，两年后的2002年7月实现整体改制，赵振元也出任改制后的信息产业电子第十一设计研究院科技工程股份有限公司（简称“十一科技”）有限公司首任董事长、院长兼党委书记。
20年后，十一科技的营收从2000年的6000万元，到2019年的125亿元，增长了202倍；利润从2000年的86万元，到2019年实现6.13亿元，增长了712倍；净资产从2000年的2000万元，到2019年底已达到了45亿元，增长了218倍；纳税从2000年的279万元，上升到2019年的2.68亿元，增长了95倍。
20年来，十一科技把握了改制、重组的重大机会，在一次次战略调整中走在了市场的前列。在集成电路为核心的电子行业，在以生物制药为核心的生物医药医疗行业，在以人工智能、数据通讯、高端制造、现代物流为核心的新基建领域，在以光伏发电与风能为核心的新能源领域，以美丽乡村为基础的城镇化建设中走在潮头。
突围，用战略引领企业发展
2000年7月，赵振元担任院长时，十一院的营收只有6000万，而其主要竞争对手的营收是十一院的数倍。当时，十一院的发展已举步维艰，赵振元担任院长不久，去上海浦东出差。获悉当时两大芯片项目已被两家竞争对手抢走，对项目心仪已久的赵振元彻夜未眠。经过一夜思考，他暗自下定决心，要改变现状，恢复十一科技在中国集成电路设计领域的主导地位。
当时的行业设计市场竞争日趋激烈，设计利润日趋下降，单纯从事设计已成为发展瓶颈。赵振元提出“设计为核心、承包为主导、经营多元化、工程国际化”的发展战略，向总承包要规模、要效益。
长期以来，半导体高端设计领域几乎被国际工程公司所垄断。十一科技高举“自主、合作、创新”三面旗帜，致力于民族高端设计服务，凭借“敢为天下先”的创新精神、“变不可能为可能”的拼搏精神，在激烈的市场竞争中奋发图强。2004年，十一科技首次打破了国际工程公司在国内8英寸芯片工程设计上的垄断，率先实现了国内设计院自主进行8英寸芯片工程的设计，这一突破是十一科技进入高端市场的里程碑。国内最先进的12英寸集成电路工程，有80%是十一科技设计的。十一科技广州LG广州8.5代OLED生产线项目是国内第一条高世代OLED生产线。国内最先进的生物制药实验室、最先进光纤光缆厂房，十一科技创造了许许多多的最先进和第一。
在赵振元的带领下，十一科技走上转型之路——2007年，向多晶硅、新能源转型；2013年，向光伏发电、现代物流、生物医疗、民用建筑等产业转型；2014年，开始投资光伏电站，并从单一工程服务向“服务与投资双轮驱动”转型。 每一次转型战略，都让十一科技突破瓶颈，化解危机、寻求转机、进而充满生机的过程，企业发展不断迈上新台阶。
改革，不断寻求新的突破
观大势，谋大事。一直以来，赵振元把企业放在国家发展、时代发展的大势之中思考。在疾风骤雨中乘风破浪，十一科技的优势在于“大船的实力，小船的灵活”。赵振元执掌十一科技20年间，十一科技历经四次重大改制。2002年，赵振元把握时不我待的历史契机，于当年7月带领十一院成功整体改制为有限公司，开创了国内大中型设计院整体改制的先河，成为名副其实的混改先锋。 2004年5月，十一科技进行了第二次改制，成为国有相对控股、员工实际控股的大型混合制设计院，为引进战略投资伙伴留出了新的空间；2010年8月，规范的股份制企业——十一科技诞生，为今后进入资本市场奠定了基础，2012年9月，“十一科技”成为国家级注册商标......
当然，改制重组之路也并非一帆风顺。2012年5月，由于多方面原因，十一科技上市受挫。面对挫折赵振元没有退缩和止步，2015年初，带领十一科技开始了与太极实业的资本重组，终于带领十一科技人叩开了资本市场的大门，赵振元成为太极实业的董事长。十一科技与太极实业合并，也是一次轻资产服务业与传统制造产业的合并，是一种创新与商业模式的转型。
2018年十一科技营收迈上了百亿大关达到107亿元后，面临持续增长的严峻考验。2019年，赵振元提出项目中小化、低利化、多元化的“三化战略”。 当时，十一科技各条发展战线全面推进，大项目都应接不暇，却要舍“大”求“小”，舍“多”取“少”，不少人难以理解。但后来的事实证明了赵振元的远见。此后国内外经济环境日益复杂，“三化战略”的实施，使企业在缺少大项目的情况下仍能破浪前进。在刚刚过去的2020年上半年，面临疫情带来的不利影响，十一科技仍然取得了历史最好成绩，表现出良好的抗压力。
创新，在思想的田野跋涉
赵振元说，作为管理者，每天面对层出不穷的问题，需要迅速作出决断，快速处理， 如果不能保持良好的状态，就会陷入疲于应付的窘境。一个优秀的企业家，不仅仅要解决企业当前的生产与生存问题,更重要的是解决明天的发展问题，引领企业走向未来。赵振元不仅是善于行动的管理者，也是勤于思考的思想者。正是勤于思考、善于总结，使他能带领企业穿过惊涛骇浪。
在管理岗位上，赵振元获得了“中国经济百名杰出人物”“中国管理创新十大杰出人才”“亚洲管理创新十大新闻人物”“中国企业改革杰出领袖”“亚洲光伏创新杰出贡献人物”等众多殊荣。
2012年，赵振元提出用平台理论全面建造新的板块，变内涵增长为开放式增长，联合社会上一切资源，共建十一科技大平台。这是一次增长模式的大突破，由内涵变为开放，竞争变为合作。
“把十一科技当做平台型公司来发展并进行组织创新，这符合全球企业战略与管理发展的趋势。”中国上市公司协会会长宋志平表示，“十一科技近年来的快速发展也证明了这次转型的成功。”
不断实践、总结再实践，当企业发展迈上新台阶时，赵振元的新书《平台理论》也问世了。一同出版的，还有两本《管理随笔》。赵振元平时除了工作，就是读书、思考、写作。在飞机上、在宾馆里、在候机厅里……只要有一点儿间隙，他都会记下自己的所感所想，20年来，利用工作间隙他撰写了大量管理随笔，发表科研论文百余篇，出版《能源科学技术与环境保护》《中外设计的竞争策略》《高科技工程的总承包实践》等多部科技专著。电子科技大学校长曾勇在给《管理随笔》的序言里这样写到：“卓越的管理者，从来都不是刻意选拔和培养出来的，而是一个‘自发过程’，管理者的见识与素养，决定了他和他的团队企业能走多远，做多大。”
除了撰写科技专著、管理著作，赵振元还经常用散文诗来记录生活点滴，表达情感和思想。他在《梦想，并不遥远》散文诗中写到，“在这个美好而又充满挑战的时代，只要我们不放弃努力，梦想就能逐步成真，一切皆有可能。”